O Guartelá é o principal canyon do Paraná e um dos maiores do Brasil em extensão. Tem como características principais a combinação de bordas bastante inclinadas, ora rochosas, ora cobertas com campos, alternadas com setores de cobertura florestal nativa bem conservada em muitos trechos. O fundo do Canyon Guartelá é percorrido pelo Rio Iapó, de águas turvas, turbulentas e velozes, com cachoeiras e corredeiras. A RPPN Itáytyba acompanha a margem direita do rio Iapó por uma distância de cerca de 5.600 m, onde este faz vigorosas curvas em uma região encaixada entre vertentes abruptas e próximas, cujo desnível máximo, dentro da RPPN Itáytyba, é de 262 m. Ao mesmo tempo em que a RPPN está na parte mais conhecida do Canyon Guartelá, está também em sua porção final, incluindo a fase em que este se transforma em um vale tradicional. Nesta porção do canyon, a margem pertencente à RPPN, exibe uma mata bastante peculiar, de árvores altas, copa fechada e com poucos extratos intermediários, estando o solo apenas coberto pela liteira, permitindo longas visadas no interior do bosque, o que o torna extremamente agradável, transmitindo uma sensação forte de paz e tranquilidade. O acesso para esta área é feito através do sítio de afloramentos rochosos da área do Iapó das Pedras.